Síndrome de Hiperestimulación Ovárica: La estimulación ovárica con elevadas dosis de gonadotrofinas lleva consigo el riesgo del síndrome de hiperestimulación, en el cual los ovarios adquieren gran tamaño y se manifiesta con dolor. Se puede presentar acumulación de fluido en la cavidad abdominal (ascitis) y, rara vez, en la torácica.

La paciente puede sufrir una acentuada distensión abdominal, náuseas y vómitos. Aproximadamente el 10% de las mujeres sometidas a la hiperestimulación ovárica presenta una forma leve de este síndrome. Menos del 1% tiene un caso severo que requerirá hospitalización. Esta condición suele resolverse espontáneamente en algunas semanas con medidas de apoyo médico.

Embarazo múltiple: En todas las técnicas de reproducción asistida la posibilidad de embarazo múltiple aumenta cuando se transfiere más de un embrión. Existen numerosas consecuencias maternas y neonatales derivadas del embarazo múltiple. En estos casos se puede necesitar reposo u hospitalización durante varias semanas e inclusive meses. Hay mayores probabilidades de que la madre desarrolle un cuadro hipertensivo del embarazo, presente abortos tardíos, parto prematuro, niños de bajo peso o con alguna malformación.

La posibilidad de un embarazo ectópico, que constituye la anidación fuera de la cavidad uterina, asciende a un 1-2% en los procedimientos de fecundación asistida.